韦小宝（梁朝伟饰）刁钻聪敏，自小随母居扬州妓院，因义气助天地会人打退清兵，被老太监私禁宫中冒充小太监。后与少年皇帝康熙（刘德华饰）成莫逆之交，并协助消灭奸臣成宫中红人。宝更误打误撞得天地会总舵主暗中收为弟子，要他伺机刺杀康，宝感左右为难。
宝无意得悉神龙教派人假扮太后潜服宫中十多年，企图盗取大清命脉藏宝图，真太后则被囚禁，康遂联合宝，几经艰险，救出太后。宝往保护老皇帝顺治途中，巧遇少女阿珂（商天娥饰），神魂颠倒。宝施妙计令康父子团聚，又挑拨神龙教人自相残杀，再建一功。
宝衣锦还乡，重遇阿珂，后更得七女同时下嫁，尽亨齐人之福。不久，江山大统，康命宝消灭天地会，宝始知康早洞悉自己秘密明末，郑成功兵败后，徐将军师陈近南复国心切，欲一挫满清锐气，率数心腹伏刺满州第一勇士鳌拜，终事败逃走。其后始知原来近南之结拜兄弟早被鳌拜收买；从中阻挠，近南一怒之下将他杀死，替其亡将报仇。另一方面，近南之将手下更中原清廷势力稳固，劝近南暂退台湾，容后再共谋反清策略，但近南坚决留守中原，与一赤胆忠肝之士成立以反清复明为本的天地会，其属下李力世，懈际中等亦誓死跟随。光阴茬苒，士数年后在杨州市丽春院中，妓女韦春花向舆儿子韦小宝相依为命，受尽市井之徒欺凌，春花恐其子终日游手好闲，欲向知府程捕头谋一官半职。知县吴之荣向知府告发明书辑略一书有造反之嫌，程捕头知此事非同小可，助荘老爷及早毁灭所有真本，反告吴之荣造谣生事，被官府揭露，遂招杀身之祸，临终向一越狱江洋大盗茅士八表露真正身份，原来其为天地会尹香主，并嘱茅十八代传口讯向鳌拜报仇。其实韦小宝早己在知府中俞听一切，顿对茅十八之英勇所为非常钦佩，二人即成好友，决意结伴往京刺杀鳌拜。
