法证部的高级化验师高彦博（欧阳震华饰），专责在犯罪现场辨证、采证与化验证物，令真凶无所遁形。他经验丰富，工作出色，备受赞许，遗憾是妻子古泽瑶（刘锦玲饰），因为意外而瘫痪，但是，多年来他对妻子不离不弃，情深一片，赢得众人，尤其是舅仔兼法医科医生古泽琛（林文龙饰）的佩服与赞誉，故而两人感情要好。
可惜瑶被诊断出患上癌症，祸不单行的她吃过博送来的食物后竟突然死亡，令人怀疑博对妻子下毒手。尤其是警察部重案组的高级督察梁小柔（蒙嘉慧饰），更怀疑博与林沛沛（陈芷菁饰）旧情复燃，迫不及待要解决瑶这个包袱。加上柔的弟弟梁小刚（郑俊弘饰）是法证部的技术员，正是博的下属，却事事受他挑剔，但博对沛之妹妹林汀汀（钟嘉欣饰）却循循善诱，令柔觉得厚此薄待，不满博。
后来，柔的父亲梁兴隆（于洋饰）因为不甘被梁兴忠所骗，与忠起争执，事后忠被杀，隆在人证、物证确凿下成为杀人疑犯。此时，博再以其客观理智的态度，与琛锲而不舍地反覆验证，找出疑点，终揭发真凶。柔喜见父亲沉冤得雪，对博大为感激，更对他博学而机智，不偏不倚的验证态度信服，对他大为改观。
琛除了法医工作之外，亦将自己的见闻创作出一系列推理小说，深受读者欢迎，女友汀亦是其拥趸之一。
未几，在琛小说中出现的败类竟相继意外死亡，初时琛与博、柔以为纯属巧合，但渐渐觉得是有人模仿琛的小说进行地下裁判，滥用私刑，琛更因此而成为争议对象，饱受压力。
汀为了替男友澄清，尽力追查凶手谁属，但正当她找到线索时，却突然受袭昏迷，生死未卜。琛大为紧张，柔决定设局引出真凶。
一日，一个神秘人暗暗向博发出了战书。一宗血案的凶手留下的指纹竟属博，所有现场的不利证据矛头均直指博，意味著整个法证部似是备受挑战。
神秘人的目的何在？博能否战胜这个高智慧的对手，还自己一个清白？柔能否助博安然渡过这一关，在感情上开花结果。
