光与暗、深陷于永无止境的战胜的世界“雷杰蒂亚”。现在、制裁之神剑将降临于此、光与暗的神话即将展开。雷杰蒂亚最大的国家—阿特兰蒂亚自从发生动乱以来已经有14年了。年幼时因为动乱的缘故而逃难的主人公—剑·立胁是一个在不知道自己的身世秘密的情况下、于边境的石之大陆—巴西菲斯生活并且健康成长的少年。
某天、剑因缘际会得到了“光辉之圣剑 闪耀之剑”、藉此展开了其壮大的冒险旅程。 一直对“剑刃合体”虎视眈眈的暗之军团突然出现在剑的面前、 此时负责守护他的是名为“布林加”的卡牌战斗护卫。 从布林加那学习到战斗方法、并且得到了关键战魂“辉龙 闪耀战龙”的剑、毅然向暗之军团发起了冲击。 “我来战斗!” 光与暗的阵营围绕着12把“剑刃合体”的战斗中、剑被选中作为Sowrd Eyes与伙伴们同心协力、 他能战胜那位自出生以来就分别了哥哥—刃吗? 然而这场纷争会导致世界走向尽头吗。
